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Intitulé de l’enseignement |
Code UE |
Crédits |
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Physico-Chimie du Vivant |
CHIM-M1-C25-S1 |
4 ECTS |
Niveau : M1
Semestre : S1
Responsable : Ludovic Jullien
Volume : 32 h
Présentation pédagogique :
Un chimiste curieux visite le comportement des systèmes biologiques. Ce cours a pour but d’analyser en termes physico-chimiques précis des phénomènes biologiques dont la manifestation pourrait étonner le chimiste.
Il se propose aussi de fournir le socle culturel et conceptuel nécessaire pour définir des systèmes chimiques reproduisant des comportements complexes observés en biologie.
Ce cours est destiné à des élèves chimistes ou biologistes ayant du goût et de l’exigence à l’interface chimie / biologie et qui souhaitent élargir leurs perspectives en chimie biomimétique ou en biologie synthétique.
Il nécessite d’avoir des bases en réactivité (bon niveau L2), en thermodynamique et en cinétique (bon niveau de L2 et/ou cours du L3 de chimie) et des bases en biologie moléculaire (bon niveau de L2 et/ou cours de biologie moléculaire de la cellule 1 et/ou 2 du L3 de chimie).
Programme
1. Interface Chimie-Biologie (perspective historique)
2. Les lieux du questionnement physico-chimique des phénomènes biologiques
3. Contrôles thermodynamique/cinétique, auto-assemblage statique/dynamique, complexité
4. La catalyse comme clef de lecture en biologie : sélectivité, réactions couplées, régulations
5. Emergence et comportement dynamique de réseaux de réactions chimiques
6. La biologie science historique (organisation et gestion de la matière, stockage et gestion de l’énergie, la question des origines).
2. Les lieux du questionnement physico-chimique des phénomènes biologiques
3. Contrôles thermodynamique/cinétique, auto-assemblage statique/dynamique, complexité
4. La catalyse comme clef de lecture en biologie : sélectivité, réactions couplées, régulations
5. Emergence et comportement dynamique de réseaux de réactions chimiques
6. La biologie science historique (organisation et gestion de la matière, stockage et gestion de l’énergie, la question des origines).
Bibliographie
Biophysical Chemistry, C. R. Cantor, P. R. Schimmel, Freeman & Co, 1980 (en particulier le tome III).
La réaction créatrice, C. Vidal, H. Lemarchand, Hermann, 1988.
Chemical Bophysics : Quantitative analysis of cellular systems, D. A. Beard, H. Qian, Cambrige University Press, 2008.
Exploring Complexity, an introduction, G. Nicolis, I. Prigogine, , Freeman & Co, 1989.
An introduction to Systems Biology, Design Principles of Biological Circuits, Chapman & Hall/CRC, 2007.
La réaction créatrice, C. Vidal, H. Lemarchand, Hermann, 1988.
Chemical Bophysics : Quantitative analysis of cellular systems, D. A. Beard, H. Qian, Cambrige University Press, 2008.
Exploring Complexity, an introduction, G. Nicolis, I. Prigogine, , Freeman & Co, 1989.
An introduction to Systems Biology, Design Principles of Biological Circuits, Chapman & Hall/CRC, 2007.